中國水利水電科學研究院于20世紀50年代開始研究生教育工作，是國務院學位委員會批準的首批“水利工程”一級學科博士和碩士學位授予單位，中組部指定的水利系統唯一承擔“西部之光”訪問學者的培養單位，設有2個一級學科（水利工程和土木工程）博士后流動站，8個博士和碩士學位授予專業，即巖土工程、水文學及水資源、水力學及河流動力學、水工結構工程、水利水電工程、水環境學、水信息學、水災害與水安全。
研究生教育發展歷程
本院的研究生教育由其下屬的研究生院和14個培養單位（即10個非贏利研究所或中心和4個科技企業）共同開展。研究生院統一組織招生、授課和學位授予，課程學習期間由研究生院實行全方位管理；課程結束后跟隨導師進入培養單位開展課題研究，直至完成學位論文。本院依托全院資源辦學，優良的科研設施設備、大量的前沿課題項目、充足的科研經費、豐富的圖書文獻資源、一流的導師隊伍及廣泛的國際合作交流等，為研究生開展學術研究、參與課題實踐、鍛煉創新能力提供了強大的科技支撐。截止2020年底，本院共有研究生導師261人，其中博士生導師89人（包括中國科學院、中國工程院院士6人），碩士生導師172人，培養博士、碩士研究生以及博士后2056人，西部之光訪問學者90人。
我院研究生的培養模式是結合國家重大水利水電工程項目的需求和戰略層面的科技支撐，開展基礎理論研究和應用基礎研究。經過60年的探索和發展，現已形成比較完整和富有特色的研究生教育體系，培養出的許多研究生已成為本學科研究領域的學術帶頭人或知名專家，不少已走上各級重要的領導崗位，或在國內外重要學術組織中擔任要職，為我院科研事業不斷開創新局面提供了重要的人才保障，也為我國水利水電事業的蓬勃發展以及水利科技行業的開拓創新做出了重要貢獻。
