中國科學院水生生物研究所（以下簡稱水生所）是國內唯一從事內陸水體生命過程、生態環境保護與生物資源利用研究的綜合性學術研究機構，其前身是1930年1月在南京成立的國立中央研究院自然歷史博物館，1934年

中國科學院水生生物研究所（以下簡稱水生所）是國內唯一從事內陸水體生命過程、生態環境保護與生物資源利用研究的綜合性學術研究機構，其前身是1930年1月在南京成立的國立中央研究院自然歷史博物館，1934年7月改組為中央研究院動植物研究所，1944年5月又分建成動物研究所和植物研究所。中國科學院成立后，于1950年2月將原中央研究院動物所、北平研究院動物學研究所、原中央研究院植物研究所藻類部門合并，組建水生所，所址上海。1954年9月遷至武漢。2001年進入院知識創新工程試點序列。2011年整體進入院“創新2020”試點工程。2015年率先進入特色研究所，2018年通過驗收，正式進入運行階段。

水生所戰略定位和發展目標是，面向國家在水生態環境保護、水生生物資源利用等方面的重大戰略需求，開展基礎性、戰略性和前瞻性重大科技問題，著力重大理論創新和核心技術突破。在淡水生態環境保護、水生生物多樣性形成與適應性演化機制、水生生物資源保護、魚類基礎生物學和遺傳育種理論、淡水漁業模式和微藻生物技術等領域繼續發揮引領作用。

水生所先后擁有15位中國科學院院士。全所現有在職職工343人，其中科技人員306人，中國科學院院士5人，發展中國家科學院院士3人，研究員及正高職稱人員88人，副研究員及副高職稱人員108人。

目前水生所設有水生生物多樣性與資源保護研究中心、淡水生態學研究中心、魚類生物學及漁業生物技術研究中心、水環境工程研究中心、水生生物分子與細胞生物學研究中心和藻類生物學及應用研究中心等6個研究中心；擁有淡水生態與生物技術國家重點實驗室（重組中）、國家淡水漁業工程技術研究中心、國家水生生物種質資源庫、湖泊水污染治理與生態修復技術國家工程實驗室等4個國家級平臺；擁有農業部淡水養殖病害防治重點實驗室、院藻類生物學重點實驗室、農業部鯽魚遺傳育種中心、湖北省水體生態工程技術研究中心、湖北省稻田綜合養殖工程技術研究中心、湖北省水生植物資源與利用工程技術研究中心、湖北省水產動物營養與飼料工程技術研究中心、湖北省淡水漁業技術創新中心等8個省部級實驗室及研究中心；擁有湖北東湖湖泊生態系統國家野外科學觀測研究站、三峽水庫香溪河生態系統實驗站、中國科學院長江上游珍稀特有魚類保護及赤水河河流生態觀測試驗站、青海湖高原湖泊濕地生態環境科學觀測站等4個野外臺站；擁有亞洲最大的淡水魚類博物館和淡水藻種庫，世界上唯一以鯨類動物保護和研究為目的的水族館-白鱀豚館，及分析測試中心平臺、水生生物數據分析管理平臺。

水生所自成立以來共有200項成果獲得獎勵，出版著作165部，發表論文8301篇。近年來，本所科學家領銜主持了一大批包括國家重大科技專項、國家重點研發計劃項目、國家基礎性專項、國家自然科學基金、中科院先導專項、地方及大型企業等各類項目經費支持，形成一批在理論上有重大突破或在應用上有廣闊前景的研究成果。近5年來，我所發表論文2183篇，其中SCI收錄1385篇。申請專利204項，獲得授權107項，出版著作11部，獲得省部級以上獎勵6項，桂建芳院士獲得2015年湖北省科學技術突出貢獻獎。一些重要技術創新或技術集成獲得成功并在應用中日臻成熟，對于我國水環境保護和漁業可持續發展起到了顯著的推動作用。這些科研產出，在魚類分子系統發育和進化、藻類生物學研究、魚類遺傳育種學、淡水生態學、水環境工程學和保護生物學等方面回答了一系列前沿科學問題，滿足了國家在水污染治理和發展生態漁業方面的重大需求，取得了重大經濟效益，產生了廣泛的社會影響。

水生所注重發揮水生生物學科技“國家隊”的作用，積極促進地方科技事業，參與地方經濟建設，取得了一系列成績。以國家淡水漁業工程技術研究中心（武漢）、農業部鯽魚遺傳育種中心為依托，促進了漁業模式和環保飼料等成果轉化，指導建設了一大批國家級和省級的水產原良種場。以湖北省和武漢市水環境工程技術研究中心為依托，推動了我所一批水環境治理方面的核心技術向全國輻射和轉化。主持培育的高產優質鳙新品種“中科佳鳙1號”、合作培育的全雌翹嘴鱖新品種“武農1號” 和全雄雜交鱧“雄鱧1號”均獲2022年全國水產原種和良種審定委員會認證的水產新品種。

水生所對外合作與交流活動頻繁。近10年來，先后派出科技人員近800人次到近30個國家和地區進行合作研究、進修或短期訪問，同時接待了來自近40個國家和地區的專家2200多人次進行學術交流、合作或進修。研究所作為核心成員加入大的國際合作研究計劃，如美國的“Tree of Life”研究計劃，還發起和引領多邊國際合作，如淡水豚類聯合調查項目、主辦“水環境保護與水污染治理”國際培訓班，“海峽兩岸人工濕地研討會”、“第十屆世界華人魚蝦營養學術研討會”、“第七屆亞太藻類論壇”等。

2022年11月5日至13日，《濕地公約》第十四屆締約方大會（COP14）在中國武漢開幕。期間，由武漢市園林和林業局主辦、水生所等承辦的COP14東道國系列活動之——“共建生命長江，傳承大河文明”主題邊會于8日召開。作為COP14最大的邊會，與會專家共同交流和討論長江大保護的研究與保護進展，分享經驗做法，講述國際大河流域水生生物資源保護的中國故事。會議還發布了由長江“十年禁漁”首倡者、中國科學院院士曹文宣領銜的“全民參與長江大保護”倡議書。

水生所是國務院學位委員會批準的首批博士、碩士學位授予權單位，設有水生生物學、遺傳學、環境科學、水產養殖學、海洋生物學等5個二級學科博士研究生培養點；動物學、水生生物學、遺傳學、環境科學、環境工程學、水產養殖等6個二級學科碩士研究生培養點；生物與醫藥、資源與環境2個工程碩士研究生培養點；設有生物學、環境科學與工程、水產學3個專業博士后流動站。在學研究生569人（碩士生263人，博士生311人），在站博士后97人。

主辦的中文核心、中國科技核心期刊《水生生物學報》連續被評為中國精品科技期刊、湖北省優秀期刊，入選《中國學術期刊影響因子年報》Q1區期刊。2022年由雙月刊改為月刊，開設“十年禁漁”、“人工濕地”等特色專欄。Water Biology and Security創刊，季刊，被DOAJ、Scopus等數據庫收錄，入選2022年度中國科技期刊卓越行動計劃高起點新刊項目。